Все правильно понимаете
И чем ниже будут эти почки в глубину--тем лучше, потому что на поверхности больше шансов подмерзнуть в неудачную зиму. И ямки можно засыпать, у меня они грибным компостом засыпаны--и ямок не наблюдается , и грунт влагу легко пропускает к корню.